La serie cuenta la vida de los hermanos Elric los cuales viven en un pueblo llamado Amestris, todo comienza cuando sus madre muere, dejándolos solos, en un intento fallido por revivir a sus madrea (utilizando alquimia avanzada) Edward pierde su pierna izquierda Alphonse, para evitar que este desaparezca Edward sacrifica uno de sus brazos para enviar el alma de su hermana a una armadura. Ahora Edward se convertirá en un miembro de la Fuerzas Armadas del Estado, para poder recuperar el cuerpo de ambos hermanos....